Le Conseil Syndical est composé de 4 collèges :

 1er collège : exécutif de 5 à 9 membres élus par le congrès sur une liste présentée par le Conseil sortant.

 2ème collège : 14 membres désignés par les 14 Sections Syndicales d’Entreprises ayant le plus grand nombre d’adhérents.

 3ème collège : 14 membres élus par le congrès, présentés par les 8 branches professionnelles et les 6 secteurs locaux du syndicat.

 4ème collège : 6 membres élus par le congrès. 2 sont présentés par la section retraités. 4 sont présentés au titre de l’interprofessionnelle dont un membre du Comité de l’Union Régionale Interprofessionnelle CFDT Rhône-Alpes et un membre de chaque bureau ou conseil d’Unions Départementales CFDT du territoire du CFDT - SCERAO.

Le Conseil Syndical se réunit toutes les 6 semaines. Chaque fois qu’il y a utilité un conseil extraordinaire peut être convoqué. Les décisions sont prises à la majorité des membres présents. Il élabore et adopte un plan de travail dans le cadre des orientations générales arrêtées par le Congrès. Il veille au respect, et si nécessaire à la mise à jour du Règlement Intérieur du SCERAO CFDT.
Il contribue à la préparation des réunions du Comité Directeur Fédéral. Il contrôle la gestion de l’Exécutif, et s’assure de la mise en œuvre des décisions, positions et revendications prises en son sein. Il met en place les commissions et groupes de travail qu’il juge nécessaire à un bon fonctionnement et leur fixe leur cahier des charges. Il est informé des désignations des délégués syndicaux et les représentants syndicaux aux comités d’établissements et d’entreprises ainsi qu’aux CHSCT.
Il est informé des désignations des délégués syndicaux centraux, des représentants syndicaux aux Comités Centraux d’ Entreprises, aux Comités de Groupes et instances européennes.
Il propose les options à soumettre au Congrès. Le Conseil Syndical favorise la démarche de coopération sans exclure le vote de positionnement, nécessité par l’actualité ou des échéances externes. Les membres du Conseil Syndical sont des dirigeants du Syndicat et votent selon la règle une personne une voix.
Deux fois par an le Conseil consacre une journée à un thème particulier. Il sera alors élargi aux militants particulièrement concernés qui participeront au débat avec voix consultative.